Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms