Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD164Q04900 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CD164Q04900 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms