Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC25A11Q02978 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms