Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPIBQ01892 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms