Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDR2Q01850 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDR2Q01850 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms