Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms