Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TFAMQ00059 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFAMQ00059 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms