Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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FAM3AP98173 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FAM3AP98173 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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FAM3AP98173 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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