Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNB1P98172 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms