Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SKOR1P84550 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms