Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRB1P82279 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRB1P82279 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRB1P82279 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CRB1P82279 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRB1P82279 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRB1P82279 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRB1P82279 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRB1P82279 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRB1P82279 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms