Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP46P62068 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP46P62068 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP46P62068 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP46P62068 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP46P62068 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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