Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVK-21P61565 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVK-21P61565 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms