Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP4BP1P59074 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP4BP1P59074 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms