Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJA9P57773 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJA9P57773 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA9P57773 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA9P57773 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms