Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEFSECP57772 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms