Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP107P57740 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms