Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSCP56915 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSCP56915 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSCP56915 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSCP56915 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSCP56915 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSCP56915 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSCP56915 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSCP56915 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSCP56915 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSCP56915 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSCP56915 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSCP56915 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms