Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP6P55212 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP6P55212 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms