Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF8P55075 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF8P55075 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF8P55075 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGF8P55075 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGF8P55075 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms