Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBX2P52951 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBX2P52951 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GBX2P52951 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GBX2P52951 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms