Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLP1P51693 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLP1P51693 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLP1P51693 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLP1P51693 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APLP1P51693 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APLP1P51693 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
APLP1P51693 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APLP1P51693 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APLP1P51693 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLP1P51693 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLP1P51693 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLP1P51693 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLP1P51693 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLP1P51693 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APLP1P51693 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms