Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRE11P49959 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRE11P49959 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRE11P49959 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRE11P49959 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms