Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms