Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CENPFP49454 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPFP49454 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPFP49454 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPFP49454 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms