Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUFMP49411 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFMP49411 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFMP49411 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFMP49411 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms