Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AMTP48728 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AMTP48728 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AMTP48728 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AMTP48728 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AMTP48728 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms