Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A4P43007 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms