Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PBX2P40425 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PBX2P40425 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PBX2P40425 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PBX2P40425 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PBX2P40425 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms