Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUP62P37198 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP62P37198 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms