Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJC1P36383 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJC1P36383 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJC1P36383 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJC1P36383 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJC1P36383 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms