Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP7BP35670 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms