Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTX2P32243 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms