Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCKARP32238 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms