Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXC12P31275 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms