Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLD1P28340 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLD1P28340 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLD1P28340 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLD1P28340 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLD1P28340 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLD1P28340 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms