Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMB5P28074 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMB5P28074 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms