Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR2AP24928 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2AP24928 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms