Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA2P24043 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA2P24043 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms