Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GCSHP23434 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GCSHP23434 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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