Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBA1P22314 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBA1P22314 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBA1P22314 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBA1P22314 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA1P22314 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA1P22314 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
UBA1P22314 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBA1P22314 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBA1P22314 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms