Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCP2P22307 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCP2P22307 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCP2P22307 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCP2P22307 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCP2P22307 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms