Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASTP20810 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASTP20810 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASTP20810 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASTP20810 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASTP20810 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASTP20810 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASTP20810 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms