Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB4AP20338 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms