Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB9P17482 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms