Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELPP16109 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELPP16109 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SELPP16109 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELPP16109 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELPP16109 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELPP16109 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELPP16109 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELPP16109 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELPP16109 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELPP16109 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELPP16109 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms