Protein–RNA interactions for Protein: P14693

SAM35, Sorting assembly machinery 35 kDa subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SAM35P14693 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 FUN30YAL019W 3396 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 UBP11YKR098C 2154 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 RGM1YMR182C 636 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 ORC2YBR060C 1863 nt2.89□□□□□ -1.95
SAM35P14693 YDL242WYDL242W 354 nt2.88□□□□□ -1.95
SAM35P14693 SAK1YER129W 3429 nt2.87□□□□□ -1.95
SAM35P14693 YAK1YJL141C 2424 nt2.87□□□□□ -1.95
SAM35P14693 SPO14YKR031C 5052 nt2.87□□□□□ -1.95
SAM35P14693 SNF5YBR289W 2718 nt2.87□□□□□ -1.95
SAM35P14693 VPS35YJL154C 2835 nt2.87□□□□□ -1.95
SAM35P14693 VPS34YLR240W 2628 nt2.87□□□□□ -1.95
SAM35P14693 YLR149CYLR149C 2193 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 PHD1YKL043W 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 COX14YML129C 213 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 SGF11YPL047W 300 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 INP2YMR163C 2118 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
SAM35P14693 ENA5YDR038C 3276 nt2.85□□□□□ -1.95
SAM35P14693 ENA2YDR039C 3276 nt2.85□□□□□ -1.95
SAM35P14693 ENA1YDR040C 3276 nt2.85□□□□□ -1.95
SAM35P14693 GRR1YJR090C 3456 nt2.85□□□□□ -1.95
SAM35P14693 YPR089WYPR089W 2667 nt2.85□□□□□ -1.95
SAM35P14693 DNL4YOR005C 2835 nt2.85□□□□□ -1.95
SAM35P14693 ROG1YGL144C 2058 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 LRG1YDL240W 3054 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 SEF1YBL066C 3447 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 AKR1YDR264C 2295 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.84□□□□□ -1.95
SAM35P14693 UBP14YBR058C 2346 nt2.84□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YBR184WYBR184W 1572 nt2.83□□□□□ -1.96
SAM35P14693 NMD2YHR077C 3270 nt2.83□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YBL053WYBL053W 375 nt2.83□□□□□ -1.96
SAM35P14693 SMY1YKL079W 1971 nt2.83□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YLL007CYLL007C 1998 nt2.83□□□□□ -1.96
SAM35P14693 TFC1YBR123C 1950 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 RPL34BYIL052C 366 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YBL109WYBL109W 336 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YOR218CYOR218C 420 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 PRP42YDR235W 1635 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 PMR1YGL167C 2853 nt2.82□□□□□ -1.96
SAM35P14693 RPS28BYLR264W 204 nt2.81□□□□□ -1.96
SAM35P14693 DBP7YKR024C 2229 nt2.81□□□□□ -1.96
SAM35P14693 RTT10YPL183C 3042 nt2.81□□□□□ -1.96
SAM35P14693 NUP120YKL057C 3114 nt2.81□□□□□ -1.96
SAM35P14693 SNU13YEL026W 381 nt2.8□□□□□ -1.96
SAM35P14693 RPB10YOR210W 213 nt2.8□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.8□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YEL043WYEL043W 2871 nt2.8□□□□□ -1.96
SAM35P14693 SWI6YLR182W 2412 nt2.8□□□□□ -1.96
SAM35P14693 PXA2YKL188C 2562 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 FLO5YHR211W 3228 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 ATG13YPR185W 2217 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 FMP16YDR070C 282 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YEL073CYEL073C 324 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 ECM12YHR021W-A 456 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 RPS12YOR369C 432 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 HEH2YDR458C 1992 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 TSC11YER093C 4293 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 NET1YJL076W 3570 nt2.79□□□□□ -1.96
SAM35P14693 NOP10YHR072W-A 177 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 BUD4YJR092W 4344 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 PEP3YLR148W 2757 nt2.78□□□□□ -1.96
SAM35P14693 MCM10YIL150C 1716 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 SMC2YFR031C 3513 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 PRP6YBR055C 2700 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 YBT1YLL048C 4986 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 RPA190YOR341W 4995 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 STE6YKL209C 3873 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 TFC4YGR047C 3078 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 MDM1YML104C 3384 nt2.77□□□□□ -1.97
SAM35P14693 CLN3YAL040C 1743 nt2.76□□□□□ -1.97
SAM35P14693 MPT5YGL178W 2580 nt2.76□□□□□ -1.97
SAM35P14693 ELG1YOR144C 2376 nt2.76□□□□□ -1.97
SAM35P14693 TAE2YPL009C 3117 nt2.76□□□□□ -1.97
SAM35P14693 HRD3YLR207W 2502 nt2.76□□□□□ -1.97
SAM35P14693 DSE4YNR067C 3354 nt2.75□□□□□ -1.97
SAM35P14693 DYN1YKR054C 12279 nt2.75□□□□□ -1.97
SAM35P14693 SIN3YOL004W 4611 nt2.75□□□□□ -1.97
SAM35P14693 RIC1YLR039C 3171 nt2.75□□□□□ -1.97
SAM35P14693 PMP1YCR024C-A 123 nt2.75□□□□□ -1.97
SAM35P14693 snR72snR72 98 nt2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.2 ms