Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKIP12755 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKIP12755 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKIP12755 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKIP12755 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKIP12755 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms