Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BMP3P12645 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BMP3P12645 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMP3P12645 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BMP3P12645 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms