Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT3P12035 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT3P12035 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT3P12035 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.3 ms